Задачами «Референс лаборатории по контролю за бактериальными инфекциями и антибиотикорезистентностью» является участие в реализации государственных программ в части обеспечения лабораторной диагностики бактериальных инфекций, сдерживания устойчивости к противомикробным препаратам в РК, в том числе внедрение системы микробиологического мониторинга за резистентностью микроорганизмов на территории РК, контроля безопасности, качества и фальсификации пищевой и другой продукции, товаров народного потребления.
        Приоритетным направлением лаборатории является осуществление программы внешней оценки качества (далее - ВОК), освоение и внедрение референсных методов исследований, стандартизация и совершенствование нормативной базы по методам лабораторной диагностики.
        Референс лаборатория по контролю за бактериальными инфекциями и антибиотикорезистентностью имеет разрешение на работу с возбудителями III-IV группы патогенности № 93 от 09.02.2006 года.
        В лаборатории проводятся микробиологические исследования объектов внешней среды и клинического материала на выявление санитарно-показательных микроорганизмов и возбудителей бактериальных инфекций III-IV групп патогенности с использованием одного или нескольких методов, в т.ч. классических бактериологических и серологических методов, методов ИФА и ПЦР, согласно утвержденной номенклатуры исследований.
        Высококвалифицированные специалисты лаборатории принимают участие в установлении причин возникновения и распространения инфекционных заболеваний бактериальной этиологии и массовых неинфекционных заболеваний (отравлений).
        Апробируются и внедряются в практику современное оборудование, методы микробиологического анализа.
        Референс лаборатория выполняет платные работы и услуги в пределах своей компетенции на договорной основе в порядке, установленном действующими распорядительными документами.
        Референс лаборатория по контролю за бактериальными инфекциями и антибиотикорезистентностью с 2013 года является членом Глобальной сети пищевых инфекций (GFN) ВОЗ, с 2014 года участвует во внешней оценке качества исследований EQAS for GFN members, ежегодно участвует во внешней оценке качества исследований по программе CАESAR, принимает участие на международных тренингах и совещаниях посвященных вопросам резистентности микроорганизмов к антибиотикам и противомикробным препаратам.
        Впервые в РК на базе референс-лаборатории была внедрена методика определения ДНК животного в пищевой продукции, которые в дальнейшем были внедрены в лабораториях общественного здравоохранения. На ее базе проходят международные и республиканские тренинги по вопросам бактериальных инфекций, антимикробной резистентности, безопасности пищевой продукции.
        С 2019 года лаборатория определена в качестве референс по вопросам антимикробной резистентности.